1998年に発売された、メタルギアシリーズ初のフルポリゴン作品。
3D空間を活かした立体的なアクション、潜入はもちろん、実写映像やポリゴンデモなどの多彩な映像とゲーム手法を織り交ぜて「反戦・反核」のメッセージをつむいでいく。
陰謀が渦巻き裏切りに裏切りを重ねるストーリーは「20世紀最高のストーリー」と称され、シリーズのその後のヒットを決定づけさせたメタルギアシリーズ正史3作目のタイトル。